１．検出検査・比較鑑定の料金
「資料に関係者の指紋が付着しているか」を知ることがご依頼者様の目的であろうかと思います。そのためには、①まず資料から指紋を検出すること（検出検査）、と②その指紋を精査し「関係者の対照用指紋」と比較すること（比較鑑定）、の二つの過程が必要となります。検出検査の結果、資料から全く指紋が検出されず比較鑑定ができない場合や逆に多数の指紋が検出され比較鑑定に膨大な手間や料金が発生してしまう場合があります。また、比較鑑定では、資料から検出した指紋と「関係者の対照用指紋」を比較するわけですが、資料から指紋が検出されなければその対照用指紋も不要となります。
当研究所では、これらのことを考え合わせ、①まず資料についての検出検査を行い、その結果をご依頼者様に結果報告します。指紋が検出されなければ検査はそこで終了となります。②続いて比較鑑定を実施するわけですが、複数の資料から多数の指紋が検出され、それらすべての資料についての比較鑑定が費用的に困難である場合には、ご依頼者様に優先的に比較鑑定する資料を指定していただき、まずそれらについての比較鑑定を実施するようにしています。
比較鑑定には、対照用資料として「関係者の指紋」が必要です。これは関係者本人の了承のもと、採取用紙にスタンプインクを使って押捺してもらうわけですが、比較的簡単な作業であり、やり直しも可能なので、原則的にはご依頼者様での実施をお願いしています。また、関係者の指紋が付着していると思われる資料との比較も可能ですが、弱い（薄い）指紋しかない場合は比較不可能という結果になってしまうことが多いので、当所では付着しやすくする試薬の新規開発も行っています。
（１）【検出検査基本料金】―検査回答書でご報告させていただきます。―
A4相当紙 ５枚まで ￥100,000（税別） １枚追加ごとに￥10,000（税別）
７枚では\120,000、10枚では\150,000（税別）
検出困難な試料や多数の試料につきましては別途相談して決めさせていただきます。 また、検出された指紋の比較鑑定につきましては、次の比較鑑定料金で承ります。
（比較鑑定回答書にてご報告させていただきます。）
（２）【比較鑑定基本料金】
指紋照合 ５組比較まで ￥100,000（税別）
１資料（Ａ４紙１枚）と関係者1人（10対照指紋）の比較を１比較とします。１資料を５人と比較する場合や５資料を１人と比較する場合は、いずれも１×５＝５比較となります。また、検出指紋相互の比較鑑定も同様の料金で承ります。
（比較鑑定回答書にてご報告させていただきます。）
指紋照合 １枚追加ごと ￥20,000（税別）
検出資料1枚と関係者６人の比較では、追加は１比較（プラス\20,000）で、計\120,000となります。（比較鑑定回答書にてご報告させていただきます。）
鑑定書作成 １比較 \100,000（税別）
検出指紋１個と関係者指紋1個との詳細な比較書類を作成します。
１ 検出検査料金
| ご依頼内容 | 数 量 | 料 金 | 例 | 報告書形式 | |
| 検出検査 | Ａ４相当紙 | ５枚まで | ¥100,000 | 検出検査回答書 | |
| １枚追加ごと | ¥10,000 | ７枚では\120,000、10枚では\150,000 | |||
| 紙以外の資料 | 上に準ずる | ||||
| 多数又は検出困難な資料 | 応相談 | ||||
| 《 ご依頼例 》 | Ａ４紙10枚 の検出検査を依頼。 | |||
| ↓ | ||||
| ＊＊個の指紋を検出したとの結果を検出検査回答書で受け取る。 | ||||
| 検出検査料金 \150,000 | ||||
２ 比較鑑定料金
| ご依頼内容 | 数 量 | 料 金 | 備 考 | 報告書形式 | |
| 比較鑑定 | （対照指紋の採取） | 原則は、ご依頼者様自身による採取となります（丁寧に指導させて頂きます） | |||
| 検出資料と関係者指紋の比較鑑定 | 5比較まで | ¥100,000 | (注) | 比較鑑定回答書 | |
| 1比較追加ごと | ¥20,000 | 検出資料1枚と関係者６人の比較では、追加は１比較（プラス\20,000）で、計\120,000となります。 | |||
| 鑑定書の作成 | １比較 | ¥100,000 | 検出指紋１個と関係者指紋1個との詳細な比較書類を作成します。 | 比較鑑定書 | |
| 《 ご依頼例 》 | 検出資料7枚と関係者１人との比較鑑定を依頼（7×1=7比較）。 | |||
| ↓ | ||||
| 対照指紋＊＊個にヒットしたとの結果を比較鑑定回答書で受け取る。 | ||||
| 比較鑑定料金 \140,000 | ||||
| さらに詳細な比較鑑定書の作成を依頼される場合は要追加料金。例えば、検出指紋と関係者指紋２組の比較（２比較）では\200,000 | ||||